Euphémus, le fils de Poséidon et d'Europe, semblait faire l'amour avec une belle nymphe, la fille du dieu des mers, Triton. Elle lui annonce bientôt qu'elle est enceinte, mais a peur de le dire à son père, qui serait sûrement très contrarié. Elle avait donc besoin d'un endroit pour se cacher et donner naissance. Alors Nymphe demanda à Euphemus de prendre une motte de terre dans ses mains et de la jeter dans la mer.

Quand Euphémos se réveilla, il ne put s'empêcher de penser à ce rêve étrange et décida d'obéir à la belle fée. Il a pris un monticule de terre sur une petite île, et dès que lui et les autres ont pris la mer pour le prochain voyage, il a jeté cette motte de terre en pleine mer. Soudain, comme par magie, une petite île apparut devant eux, qui offrit un refuge sûr à la nymphe, et là, elle donna naissance à un fils. Euphemos a nommé cette île Kallisté (qui signifie "la plus belle"), et leur fils commun a été nommé Theras. Plus tard, le nom "Thera" a été adopté pour l'île.

Bien que nous soyons maintenant dans le domaine de la légende et de la fantaisie, des études scientifiques montrent que le récit selon lequel l'île est apparue soudainement et de nulle part n'est peut-être pas loin de la vérité. En fait, les géologues pensent que l'île de Santorin a été formée par l'activité volcanique lorsqu'un plus grand volcan est entré en éruption dans la région.